男性極少發生尿路感染，女性易感這與女性特殊的生理結構有關，應根據它的部位和類型分別給予不同的治療。對於首次發生的尿路感染應立即用抗菌素進行短程治療，一般用藥7--14天爲1個療程。對於經常復發的尿路感染也應使抗菌素治療，但應考慮用長療程低劑量的方法進行治療並輔助使用一些中藥藥物治療降低抗菌素對身體的傷害。
選用抗菌素應參照的標準：在尿細菌培養結果出來之前，可先試用複方新諾明、呋喃坦啶、氟哌酸或氨苄青黴素等；對較嚴重的尿路感染，可以選擇兩種抗菌素聯合用藥；避免使用對腎臟有毒性作用的抗菌素，如慶大黴素、卡那黴素、丁胺卡那黴素、妥布黴素、多粘菌素等。
